MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008258	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008258	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008258	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008258	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008258	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008258	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008258	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008258	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008258	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008258	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008258	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008258	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008258	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008258	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008258	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008258	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008258	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008258	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008258	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008258	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008258	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008258	TGC	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008258	GCTGCC	13	78	7105	7182	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008258	CGC	2	6	7269	7274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008258	GCC	2	6	7275	7280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008258	GCCA	2	8	7292	7299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008258	TTA	2	6	7349	7354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008258	CAG	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008258	AAT	2	6	7473	7478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008258	GGA	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008258	CG	3	6	7619	7624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008258	GCA	2	6	7729	7734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008258	CGG	2	6	7766	7771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008258	CG	3	6	7811	7816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008258	CAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008258	TAA	2	6	8000	8005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008258	A	6	6	8011	8016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008258	GCAT	2	8	8021	8028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008258	AAG	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008258	TA	3	6	8090	8095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008258	TGG	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008258	CGG	2	6	8216	8221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008258	CGT	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008258	ATC	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008258	CTGT	2	8	9305	9312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008258	C	6	6	9965	9970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_008258	G	6	6	9975	9980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008258	ATC	3	9	10572	10580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008258	GAAT	2	8	10581	10588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008258	AAT	2	6	10594	10599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008258	ATA	2	6	10635	10640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008258	GAAAAT	2	12	10678	10689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008258	CTG	2	6	11902	11907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008258	AGA	2	6	11914	11919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008258	TCTTT	2	10	11933	11942	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008258	TTA	2	6	11943	11948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008258	T	6	6	11952	11957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008258	ATTC	2	8	11977	11984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008258	A	6	6	12057	12062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008258	TGA	2	6	12080	12085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008258	TAG	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008258	AGTG	2	8	12119	12126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008258	A	7	7	12134	12140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008258	ATG	2	6	12196	12201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008258	AT	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008258	A	6	6	14226	14231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008258	CCG	2	6	15455	15460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008258	GCC	2	6	15555	15560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008258	CGG	2	6	15565	15570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008258	ATC	2	6	15597	15602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008258	TGC	2	6	15609	15614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008258	CT	3	6	15622	15627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008258	GACA	2	8	15749	15756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008258	CGC	2	6	15769	15774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008258	TAT	2	6	15775	15780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008258	CT	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008258	T	6	6	15852	15857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008258	ATT	2	6	15867	15872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008258	ATT	2	6	15899	15904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008258	GAC	2	6	15905	15910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008258	ATT	2	6	15918	15923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008258	ACA	2	6	15958	15963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008258	AATT	2	8	15964	15971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008258	TAAT	2	8	15983	15990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008258	TTC	2	6	16091	16096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008258	A	6	6	16107	16112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008258	ATT	2	6	16116	16121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008258	GAT	2	6	16146	16151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008258	GA	3	6	17425	17430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008258	ATT	2	6	18409	18414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008258	AATA	2	8	18453	18460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008258	CTTC	2	8	18475	18482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008258	AGT	2	6	18500	18505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008258	CAT	2	6	18539	18544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008258	T	6	6	18598	18603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008258	ATG	2	6	18714	18719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008258	TA	3	6	19542	19547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008258	GT	3	6	19749	19754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008258	TC	3	6	19755	19760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008258	AGC	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008258	A	7	7	19785	19791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008258	CTT	2	6	20163	20168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008258	GCA	2	6	20286	20291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008258	TTC	2	6	20302	20307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008258	CTT	2	6	20339	20344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008258	TGA	2	6	21410	21415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008258	AGC	2	6	26217	26222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008258	T	6	6	26259	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008258	GAA	2	6	26267	26272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008258	TCAT	2	8	27216	27223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008258	TCCC	2	8	27246	27253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008258	TGGC	2	8	27287	27294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008258	TAT	2	6	28191	28196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008258	ATTTA	2	10	28213	28222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008258	TCT	2	6	28312	28317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008258	TGT	2	6	28323	28328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008258	TCT	2	6	28388	28393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008258	TGC	2	6	28394	28399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008258	GAT	2	6	28424	28429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008258	CATG	2	8	28456	28463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008258	ATA	2	6	28473	28478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008258	A	6	6	28480	28485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008258	GCC	2	6	28528	28533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008258	TCG	2	6	28547	28552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008258	TCA	2	6	28578	28583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008258	AGTG	2	8	28606	28613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008258	TGA	2	6	33083	33088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008258	T	9	9	33095	33103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008258	TGA	2	6	33140	33145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008258	TGT	2	6	33721	33726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008258	TTCT	2	8	35264	35271	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008258	GGGC	2	8	36840	36847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008258	GCG	2	6	38140	38145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008258	ATTT	2	8	40940	40947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008258	GTTT	2	8	40957	40964	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008258	ATT	3	9	40988	40996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008258	TTA	2	6	41112	41117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008258	A	7	7	41145	41151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008258	ACC	2	6	41340	41345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008258	ACG	2	6	41353	41358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008258	TGA	2	6	42228	42233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008258	AATCA	2	10	42254	42263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008258	ATG	2	6	42279	42284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008258	GAT	2	6	42355	42360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008258	GGC	2	6	42454	42459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008258	GCG	2	6	42482	42487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008258	CGG	2	6	42553	42558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_008258	GT	3	6	114319	114324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_008258	A	6	6	175534	175539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_008258	GGAT	2	8	175570	175577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
431	NC_008258	A	6	6	175640	175645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_008258	GAA	2	6	175653	175658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_008258	ATT	2	6	175671	175676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_008258	TA	3	6	180459	180464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_008258	GCG	2	6	181319	181324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_008258	GAAA	2	8	182449	182456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
451	NC_008258	ATAA	2	8	183196	183203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008258	TTG	2	6	183258	183263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_008258	GC	3	6	183285	183290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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455	NC_008258	TAA	2	6	183364	183369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_008258	TG	4	8	183425	183432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_008258	GGC	2	6	184081	184086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_008258	AGT	2	6	185462	185467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_008258	A	6	6	185497	185502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_008258	AGTT	2	8	188503	188510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
466	NC_008258	GAA	2	6	188513	188518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
467	NC_008258	ATA	2	6	188522	188527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_008258	GTAGTG	2	12	190983	190994	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_008258	ACT	2	6	195769	195774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_008258	GAT	2	6	195776	195781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_008258	ACCGC	2	10	195798	195807	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
473	NC_008258	A	6	6	195812	195817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_008258	GGC	3	9	195818	195826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_008258	TTGC	2	8	203397	203404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_008258	G	6	6	203413	203418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
490	NC_008258	GAC	2	6	203478	203483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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492	NC_008258	GCA	2	6	203528	203533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_008258	AG	3	6	203591	203596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
494	NC_008258	CTG	2	6	203610	203615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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